ConfigurationSection がロックされているときに編集することはできませんが SectionInforamtion.OverrideMode を明示的に OverrideMode.Allow に設定してロックを解除できます

ConfigurationSection がロックされているときに編集することはできませんが、SectionInforamtion.OverrideMode を明示的に OverrideMode.Allow に設定してロックを解除できます。