REG FLAGS キー名 QUERY | SET DONT_VIRTUALIZE DONT_SILENT_FAIL RECURSE_FLAG キー名 "HKLM\Software"[\サブキー (ローカル コンピューター上の これらのキーのみに制限) ...

REG FLAGS キー名 [QUERY |
                   SET [DONT_VIRTUALIZE] [DONT_SILENT_FAIL] [RECURSE_FLAG]]

  キー名    "HKLM\Software"[\サブキー] (ローカル コンピューター上の
        これらのキーのみに制限)。
    サブキー    HKLM\Software の下のレジストリ キーの完全名。
  DONT_VIRTUALIZE DONT_SILENT_FAIL RECURSE_FLAG
    SET で使用すると、コマンド ライン上で指定されたフラグが設定されます。
        指定されていないフラグはクリアされます。

例:

  REG FLAGS HKLM\Software\MyCo\MyApp QUERY
    キー MyApp の現在のフラグを表示します。

  REG FLAGS HKLM\Software\MyCo\MyApp SET DONT_VIRTUALIZE /s
    MyApp とそのすべてのサブキーで DONT_VIRTUALIZE フラグを設定します。
    (DONT_SILENT_FAIL と RECURSE_FLAG をクリアします)