Não é possível excluir um pool de aplicativos que contém aplicativos. No IIS, você terá que excluir todos os aplicativos ...

Não é possível excluir um pool de aplicativos que contém aplicativos. No IIS, você terá que excluir todos os aplicativos desse pool ou reatribuí-los a outro pool editando as propriedades de cada aplicativo. Na guia Diretório Base, digite o diretório de outro pool de aplicativos e, em seguida, exclua o pool de aplicativos do SharePoint Server.